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如果您的公司使用了虚拟注册地址，并被工商部门查实，这可能会涉及到违反相关法规的问题。面对这种情况，可以采取以下步骤应对。
1、配合调查：工商部门会对企业进行例行检查或专项调查，应当积极配合，如实提供相关信息和资料。
2、咨询专业人士：考虑咨询律师或专业的企业咨询机构，了解详细情况和可能的法律后果，他们会为您提供专业的建议，并帮助您制定应对策略。
3、搬迁或更正地址：如果虚拟注册地址确实存在问题，应考虑尽快将公司地址迁至实际经营场所，并确保新的地址符合相关法规要求，确保所有相关文件和信息都已更新。
4、接受处理结果：根据工商部门的调查结果和法规要求，可能会面临罚款、整改或其他行政处罚，应当按照要求接受处理，并按时缴纳相关费用。
5、改正并合规经营：不论此次事件的结果如何，都应吸取教训，确保公司未来的经营符合法规要求，确保使用真实的注册地址，并合法合规经营。
建议仅供参考，具体的法律后果和处理方式可能因地区和具体情况而异，建议您在遇到问题时及时咨询专业人士，以确保合法合规经营。